Nouveau coronavirus détecté chez les patients et la source peut être des chiens

Personne ne veut entendre des nouvelles d'un coronavirus. Nous en avons assez. Mais, plus nous en savons, mieux nous pouvons essayer de vivre. Cette nouvelle vient de Malaisie où des scientifiques ont connecté un coronavirus chez le chien qui pourrait être transmis à l'homme.

Modèles de transmission du coronavirus

Au cours des 20 dernières années, de nouveaux coronavirus ont émergé d'animaux avec une régularité remarquable. En 2002, le SRAS-CoV est passé des civettes aux humains. Dix ans plus tard, le MERS a émergé des chameaux. Puis en 2019, le SRAS-CoV-2 a commencé à se propager dans le monde.

Pour de nombreux scientifiques, ce schéma indique une tendance inquiétante: les épidémies de coronavirus ne sont pas des événements rares et se produiront probablement toutes les dix ans environ.

Maintenant, les scientifiques rapportent qu'ils ont découvert ce qui pourrait être le dernier coronavirus à passer des animaux aux humains. Et cela vient d'une source surprenante: les chiens.

Lorsque la pandémie de COVID-19 a explosé pour la première fois, le Dr Gregory Gray a commencé à se demander s'il pourrait y avoir d'autres coronavirus qui rendaient déjà les gens malades et menaçaient de déclencher une autre épidémie.

Le problème était qu'il n'avait pas d'outil pour les chercher. Le test du COVID-19, dit-il, est extrêmement limité. Il indique si un virus particulier - le SRAS-CoV-2 - est présent dans les voies respiratoires d'une personne, et rien d'autre.

«Les diagnostics sont très spécifiques. Ils se concentrent généralement sur les virus connus», déclare Gray, épidémiologiste des maladies infectieuses au Global Health Institute de l'Université Duke.

Il a donc mis au défi un étudiant diplômé de son laboratoire, Leshan Xiu, de faire un test plus puissant - un test qui fonctionnerait comme un test COVID-19 mais pourrait détecter tous les coronavirus, même les inconnus.

Xiu a non seulement relevé le défi, mais l'outil qu'il a créé a mieux fonctionné que prévu.

Dans le premier lot d'échantillons testés l'année dernière, Gray et Xiu ont trouvé des preuves d'un tout nouveau coronavirus associé à la pneumonie chez les patients hospitalisés - principalement chez les enfants. Ce virus pourrait être le huitième coronavirus connu pour provoquer des maladies chez les humains, rapporte l'équipe jeudi dans le journal Clinical Infectious Diseases.

Les échantillons provenaient de patients d'un hôpital du Sarawak, en Malaisie, prélevés par un collaborateur en 2017 et 2018. «Il s'agissait de prélèvements nasaux profonds, comme les médecins recueillent avec les patients COVID-19», explique Gray.

Les patients avaient ce qui ressemblait à une pneumonie régulière. Mais dans huit des 301 échantillons testés, soit 2.7%, Xui et Gray ont constaté que les voies respiratoires supérieures des patients étaient infectées par un nouveau coronavirus canin, c'est-à-dire un virus canin.

«C'est une prévalence assez élevée d'un [nouveau] virus», dit Gray. "C'est remarquable." Si remarquable, en fait, que Gray pensa que peut-être lui et Xiu avaient fait une erreur. Peut-être que le test de Xiu ne fonctionnait pas tout à fait correctement. «Vous vous demandez toujours s'il y avait un problème dans le laboratoire», dit-il.

Pour le savoir, il a envoyé les échantillons des patients à un expert mondial des coronavirus animaux de l'Université d'État de l'Ohio. Elle était également dubitative. "J'ai pensé:" Il y a quelque chose qui ne va pas ", dit virologue Anastasia Vlasova. "On ne pensait pas que les coronavirus canins se transmettaient aux humains. Cela n'a jamais été signalé auparavant."

Croissance du coronavirus dans les laboratoires de recherche

Néanmoins, Vlasova est allée travailler. Elle a essayé de cultiver le coronavirus en laboratoire, en utilisant une solution spéciale qui, selon elle, fonctionnait pour d'autres coronavirus canins. Et voilà, "le virus s'est très bien développé", dit-elle.

Avec beaucoup de virus sous la main, Vlasova pourrait décoder son génome. À partir des séquences génétiques du virus, elle pouvait voir que le virus avait probablement infecté des chats et des porcs à un moment donné. Mais il est probablement passé directement des chiens aux humains. «La majorité du génome était le coronavirus canin», dit-elle.

Puis elle a trouvé un indice inquiétant sur l'avenir du virus. «Nous avons découvert une mutation - ou une suppression - très, très unique dans le génome», dit Vlasova. Cette suppression spécifique, dit-elle, n'est présente dans aucun autre coronavirus chien connu, mais elle se trouve ailleurs: dans les coronavirus humains. «C'est une mutation très similaire à celle trouvée précédemment dans le coronavirus du SRAS et dans [les versions de] SARS-CoV-2 ... [qui est apparue] très peu de temps après son introduction dans la population humaine», dit Vlastova.

Cette suppression, croit-elle, aide le virus du chien à infecter ou à persister à l'intérieur des humains. Et cela peut être une étape clé nécessaire pour que les coronavirus fassent le saut dans les gens.

«Apparemment, la suppression est en quelque sorte associée à l'adaptation [du virus] lors de ce saut d'animal à humain», dit-elle.

Au total, ces données génétiques suggèrent que Vlasova et ses collègues attrapent ce nouveau coronavirus au début de son voyage chez les humains, alors qu'ils essaient toujours de comprendre comment infecter efficacement les gens - et peut-être, avant qu'il ne se propage d'une personne à l'autre et se déclenche. une grosse épidémie.

"Il n'y a pas encore de preuve de transmission d'humain à humain", déclare un virologue Xuming Zhang à l'Université de l'Arkansas pour les sciences médicales. Mais on ne sait pas comment ces patients ont été infectés par le virus ou s'ils ont eu un contact direct avec des animaux infectés.

Zhang étudie les coronavirus depuis plus de 30 ans. Il pense qu'il est trop tôt pour appeler ce nouveau virus un agent pathogène humain. "Comme les auteurs prennent soin de le dire dans leur article, ils n'ont pas prouvé ce qu'on appelle Les postulats de Koch ", dit-il. Autrement dit, Vlasova, Gray et ses collègues n'ont pas montré que le nouveau coronavirus provoque une pneumonie; jusqu'à présent, il n'a été associé qu'à la maladie.

«Pour ce faire, strictement, ils doivent injecter le virus aux humains et voir s'il reproduit la maladie», dit-il. "Bien sûr [pour des raisons éthiques], nous ne pouvons pas faire cela."

Au lieu de cela, dit Zhang, ils peuvent regarder pour voir à quel point le virus est commun chez les patients atteints de pneumonie dans le monde - et ils peuvent tester pour voir si cela rend les souris ou un autre animal malade.

Le coronavirus chez les chiens pourrait infecter les humains

Pourtant, Zhang dit qu'il ne serait pas surpris si ce virus canin est, en fait, un nouvel agent pathogène humain. Il pense que plus les scientifiques recherchent des coronavirus inconnus chez les patients atteints de pneumonie, plus ils en trouveront. "Je crois qu'il existe de nombreux animaux [coronavirus] qui peuvent se transmettre aux humains."

Et pour arrêter une future pandémie de coronavirus, dit-il, les scientifiques doivent faire plus de tests sur les personnes et rechercher ces infections étranges et cachées - avant qu'elles ne deviennent un problème.